新研究“直擊”結(jié)核病基因組與耐藥性
日期:2013-09-03 09:01:22
數(shù)個(gè)獨(dú)立研究團(tuán)隊(duì)為來(lái)自世界不同地區(qū)的結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行了全基因組測(cè)序,成果于9月2日發(fā)表在《自然—遺傳學(xué)》期刊上。相關(guān)研究有望為耐藥性結(jié)核病疫情的出現(xiàn)提供新見(jiàn)解,并為耐藥性測(cè)試和藥物開(kāi)發(fā)提供新標(biāo)靶。
美國(guó)馬薩諸塞州總醫(yī)院教授Maha Farhat領(lǐng)銜的研究小組,為全球123種具有代表性的結(jié)核分枝桿菌菌株(包括耐藥性菌株)進(jìn)行了全基因組測(cè)序和分析。該研究小組借鑒了菌株之間的進(jìn)化關(guān)系,開(kāi)發(fā)出一種在微生物基因組中搜尋耐藥性標(biāo)記的新方法,并在結(jié)核分枝桿菌的基因組中確認(rèn)了39個(gè)與耐藥性有關(guān)的基因組區(qū)段。
來(lái)自美國(guó)新澤西醫(yī)學(xué)院的David Alland教授與其研究團(tuán)隊(duì),為滲入了一線抗結(jié)核藥乙胺丁醇的結(jié)核分枝桿菌菌株進(jìn)行了基因組測(cè)序,并在63個(gè)臨床菌株中找到與研究結(jié)果相關(guān)的發(fā)現(xiàn)。他們的功能研究為一個(gè)多步驟、包含了基因突變相互作用的乙胺丁醇耐藥模型提供了支持理?yè)?jù)。
最后,西班牙公共健康研究中心教授Inaki Comas及其同事分析了259個(gè)結(jié)核分枝桿菌菌株復(fù)合體基因組序列,為這種病菌的遺傳多樣性和與人類宿主一起的進(jìn)化過(guò)程提供了見(jiàn)解。分析結(jié)果顯示,分枝桿菌菌株復(fù)合體約70萬(wàn)年前在非洲出現(xiàn),然后隨人類遷徙而蔓延出非洲。
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