《分子細胞》:表觀遺傳信息傳遞是一個兩步驟過程
日期:2014-03-24 09:01:09
目前,印第安那大學(IU)的科學家們解開了現(xiàn)代遺傳學的一個謎團:獲得性狀如何在一個稱為表觀遺傳信息傳遞(epigenetic inheritance,通過有絲分裂或減數(shù)分裂來傳遞非 DNA 序列遺傳信息的現(xiàn)象)的過程中世代傳遞?這項研究發(fā)現(xiàn),根據(jù)DNA中的信息,細胞并不知道該沉默哪些基因,但是它們能識別添加到基因中的化學遺傳標記。這些化學標簽起分子記憶的作用,使細胞能夠識別基因,并記住它們,在新的世代中再次沉默它們。
由IU生物學家和生物化學家Craig Pikaard帶領的一個研究小組完成的這些研究成果,為植物細胞如何知道在每一世代中沉默一個遺傳位點,提供了重要的新見解。相關研究結果發(fā)表在2014年3月20日的《分子》(Molecular Cell)雜志。
細胞并不依賴內在的DNA序列信息,而是通過依賴DNA和蛋白質復合物(稱為染色質)上的化學標記,來沉默特定的位點。常見的染色質化學修飾方式有甲基化-去甲基化,乙?;?/span>-去乙?;?,磷酸化-去磷酸化等等。
使染色質標記永久存在的能力,其實充當一種表觀遺傳記憶的形式,使沉默位點具有識別性,這是細胞將機器傳遞給位點所需要的一種預先設定的狀態(tài),其在一個多步驟過程(稱為RNA指導的DNA甲基化,RdDM)中完成了基因沉默。RdDM包括短的干擾RNA(siRNA),siRNA是24核苷酸長的小RNA分子,可指導甲基原子團添加到匹配的DNA鏈,最終使基因不起作用。
Pikaard說:“重要的是,這項工作表明,沉默位點識別對于基因沉默必不可少。我們發(fā)現(xiàn),表觀遺傳信息傳遞是一個兩步驟過程,這兩個獨立的步驟一起引起了沉默狀態(tài)的表觀遺傳信息傳遞。”
科學家們之所以對表觀遺傳信息傳遞感興趣,是因為它是一個重要的過程,在這個過程中發(fā)生的基因功能的可遺傳修飾是必不可少的,而生物體DNA堿基序列沒有發(fā)生變化。某些疾病如癌癥,偶爾發(fā)生在一個人的一生中,越來越多人認為其具有一個表觀遺傳基礎。
Pikaard指出,這項新工作不僅對表觀遺傳信息傳遞的機制提出了新的見解,這是遺傳學和染色體生物學領域一個廣泛關注的話題,而且還有助于解釋兩種植物特異基因沉默酶——RNA 聚合酶Pol IV和Pol V——的招募基礎,在1999年,Pikaard首先發(fā)現(xiàn)了這兩種酶。
研究人員檢測和鑒定了脫乙?;?/span>6(HDA6)——去除組蛋白乙?;囊环N酶,和甲基化轉移酶MET1之間的關系,他們發(fā)現(xiàn),這兩種酶在維持甲基化中的伙伴關系,可以解釋導致沉默位點識別的表觀遺傳記憶永久性。
Pikaard說:“總的來說,我們的研究結果表明,通過HDA6和MET1,沉默位點識別可在世代之間延續(xù)相傳。這些活動不足以沉默位點,但是能保持一種染色質狀態(tài),這是Pol IV招募、siRNA生物合成和RdDM所必需的。”
當研究人員在模式植物擬南芥(Arabidopsis thaliana)的Pol IV和Pol V突變株中去除RdDM通路后,所有基因沉默都消失,但是沉默位點識別仍然存在。然后他們將HDA6和指定沉默位點識別的MET1依賴性過程去除,沉默位點識別所需的表觀遺傳記憶消失,并無法恢復。
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