罕見病系列報(bào)道:單基因遺傳病基因檢測
日期:2014-11-13 09:05:16
2014年11月,第二屆國際罕見病研究聯(lián)盟會(huì)議在深圳舉辦,此次會(huì)議在國際罕見病研究聯(lián)盟、華大基因、中華醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)分會(huì)、中國稀有病聯(lián)盟、中國罕見病發(fā)展中心及國家基因庫和中華醫(yī)學(xué)會(huì)的參與和支持下,創(chuàng)下了罕見病會(huì)議史上規(guī)模最大、參會(huì)人員最多、演講人員水平最高的會(huì)議紀(jì)錄。
一對小夫妻高興的迎來了他們的第一個(gè)小生命,在妻子懷孕12周的時(shí)候去醫(yī)院產(chǎn)檢,結(jié)果意外的發(fā)現(xiàn)自己攜帶了1個(gè)苯丙酮尿癥的基因PAH的致病突變(p.Arg53His,雜合),但是她與她丈夫都沒有家族史和不良妊娠史,那到底胎兒健不健康呢?
之后丈夫也進(jìn)行了基因檢測,發(fā)現(xiàn)其PAH基因上攜帶了1個(gè)致病突變(p.Phe392IIe,雜合),這就大大增加了他們后代患上苯丙酮尿癥的可能性,據(jù)醫(yī)生推斷,這一胎兒有四分之一的可能性患上苯丙酮尿癥。
為此夫妻倆商量做了產(chǎn)前診斷,果然,結(jié)果顯示胎兒為苯丙酮尿癥患者,他們選擇了放棄。之后終于在第二胎的時(shí)候顯示為攜帶者,出生后做新生兒遺傳代謝病篩查結(jié)果正常。
這種苯丙酮尿癥就是一種單基因遺傳病,所謂單基因遺傳病是指單個(gè)基因發(fā)生突變引發(fā)的遺傳病,這類疾病其實(shí)數(shù)量不少,就目前發(fā)現(xiàn)的而言就已經(jīng)有7000多種,這其中也包括我們常聽說的地中海貧血,遺傳學(xué)耳聾等。
對于不少健康人來說,這些疾病好似相隔甚遠(yuǎn),與自己關(guān)系不大,然而數(shù)據(jù)表明這類疾病雖然單一發(fā)病率低,但是綜合發(fā)病率卻高達(dá)百分之一,而且大多數(shù)單基因遺傳病會(huì)致死,致畸或致殘,現(xiàn)在也僅有1%的有有效的治療藥物,且這些藥物也不便宜,治療費(fèi)用高,就算治好了存活下來的患兒也大多終生殘疾或有智力障礙。
這是一種可怕的現(xiàn)狀,更可怕的是隨著國內(nèi)取消了強(qiáng)制性的婚檢產(chǎn)檢,一些小兩口認(rèn)為自己身體健康,家里人也都沒啥特殊的毛病,因此忽略了這方面的檢測。要知道,從理論上說,每個(gè)健康的家庭都有生育一些遺傳病的可能性,而且研究也顯示平均每人攜帶有2.8個(gè)隱形遺傳病的致病突變(0-7個(gè)),因此萬事做好準(zhǔn)備總是令人放心一些。
目前進(jìn)行單基因遺傳病檢測,常用的技術(shù)包括基因組測序,基因芯片,液相芯片,變性高效液相色譜分析DHPLC等。比如華大醫(yī)學(xué)采用的是目標(biāo)序列捕獲+高通量測序技術(shù),具體來說,就是通過一套寡核苷酸探針捕獲基因組DNA中的目標(biāo)區(qū)域(基因的外顯子及剪切位點(diǎn)序列),然后進(jìn)行高通量測序和生物信息學(xué)分析,獲取目標(biāo)區(qū)域的基因變異信息定位致病突變。
而臨床所說的基因芯片通常是指微陣列比較基因組雜交芯片,也被稱為array CGH。基因芯片能夠檢測出常規(guī)染色體檢查所不能檢出的染色體微缺失和微重復(fù)綜合征,是目前針對智力低下和發(fā)育落后患兒的最佳診斷方法。
液相芯片以Luminex xMAP 技術(shù)為代表,這種技術(shù)的核心是把直徑為 5.6 m 的聚苯乙烯小球用熒光染色的方法進(jìn)行編碼,通過調(diào)節(jié)2種熒光染料的不同配比,獲得最多可達(dá)100 種具有不同特征的熒光譜微球,然后將每種編碼微球共價(jià)交聯(lián)上針對特定檢測物的抗原,抗體或核酸探針等捕獲分子,應(yīng)用時(shí),先將針對不同檢測物的編碼微球混合,再加入微量待檢樣本,在懸液中,靶分子與微球表面交聯(lián)的捕獲分子發(fā)生特異性結(jié)合,在一個(gè)反應(yīng)孔內(nèi)可同時(shí)完成多達(dá)100 種不同的檢測反應(yīng)。
此外還有DHPLC,這種方法可在部分變性的條件下,通過雜合與純合二倍體在柱中保留時(shí)間的差異,以檢測 DNA的突變。另外MassARRAY 分子量陣列技術(shù)也可以通過 PCR 擴(kuò)增目標(biāo)序列,然后加入檢測位點(diǎn)序列特異性延伸引物,在一個(gè)被檢測的位點(diǎn)上,延伸1個(gè)堿基,進(jìn)行檢測,這種方法適合于全基因組研究發(fā)現(xiàn)的結(jié)果驗(yàn)證,或者是確定的有限數(shù)量的研究位點(diǎn)研究。